いいえ、共有されません。案内状ひな形は本坊・支坊の連携設定の対象外で、常に自坊のみで管理されます。支坊で使いたい場合は、支坊側でも別途登録してください。
案内状ひな形を削除しても、既に作成済みの案内状自体は削除されません。ただし、その案内状で文面を印刷しようとすると「ひな形が設定されていません」というエラーになります。